Zdravstvene prednosti probiotika nisu povezane samo sa sojevima koji se koriste, već su usko povezani i sa dozom. Naučna istraživanja pokazuju da se probiotici mogu kolonizirati, umnožavati i vršiti regulatorne efekte u crijevima samo kada se konzumiraju u dovoljnim količinama. To im omogućava da poboljšaju mikrobiotu crijeva, promovišu probavu i apsorpciju hranjivih tvari ili poboljšaju imunitet. Međutim, efektivna doza varira ovisno o soju. Na primjer, neki sojevi mogu proizvesti pozitivne efekte pri dnevnom unosu od samo nekoliko stotina miliona živih ćelija, dok su drugima potrebne veće količine da bi se postigla primjetna korist.
Za isti soj, unutar određenog raspona, generalno je vjerojatnije da će veća doza proizvesti značajne zdravstvene koristi od niže doze. Međutim, to ne znači da je "više uvijek bolje". Prekoračenje preporučene doze neće kontinuirano pojačavati učinak i može čak dovesti do gubitka ili, u nekim slučajevima, povećati rizik od gastrointestinalne nelagode.
Štoviše, budući da različiti sojevi imaju različite karakteristike i mehanizme djelovanja, jednostavno poređenje broja živih stanica u proizvodu ne ukazuje na njegovu ukupnu efikasnost. Naučniji način za procjenu efikasnosti probiotika je pozivanje na kliničke dokaze koji podržavaju određeni soj, a ne samo na količinu. Prilikom odabira proizvoda, potrošači bi se trebali fokusirati na sojeve s podacima iz kliničkih istraživanja i autoritativnim certifikatom, birajući one koji odgovaraju njihovim individualnim potrebama umjesto da slijepo traže velike doze ili golem broj živih bakterija.